和败血症相鉴别，和TORCH综合征相鉴别。

临床诊断应从本病患儿的临床特点和流行病学资料两方面分析提出

1、婴儿健康搜索的临床特点：围产新生儿发病急剧不明原因的发热。有上呼吸道感染或败血症样表现，合并心肌损害。有感染的临床表现，但病情进展迅速病情危重不支持细菌感染者。

2、流行病学资料：新生儿集中发病夏秋季节。母亲或婴儿室医护人员近期有发热等感染病史同婴儿室有类似上呼吸道感染发烧患儿，同期发病或相继起病者。

上述临床特点结合实验室检查和辅助检查可确诊。