患者消瘦，营养不良，腹泻，呈脂肪便。本病患者空肠粘膜上皮的绒毛及微绒毛呈明显萎缩，粘膜表面扁平。粘膜固有层显慢性炎性改变，有淋巴细胞、浆细胞，有时有嗜酸性粒细胞浸润。如患者饮食不含麸质类食物，则上述肠粘膜病变可以恢复。

加到体外培养的空肠粘膜上，可见引起组织内T细胞增生。