致病菌为革兰氏阴性需氧菌，如大肠杆菌和绿脓杆菌。某些临床学家则认为革兰氏阳性细菌(如葡萄球菌、链球菌、类白喉菌)也可引起前列腺炎，但与革兰氏阴性菌引起的前列腺感染不同，革兰氏阳性菌引起的前列腺感染很少迁延不愈或导致感染反复发作，除肠球菌引起的前列腺炎例外。但也有许多作者对革兰氏阳性菌引起慢性前列腺炎持怀疑态度。目前有证据表明衣原体、支原体也可引起前列腺感染，但较少见。