红斑狼疮是一种自身免疫性疾病，其治疗需要综合考虑多种因素。在选择干细胞治疗红斑狼疮的医院时，可以考虑以下几家：
1. 北京协和医院：作为国内知名的综合性医院之一，北京协和医院在干细胞治疗领域有着丰富的经验和专业的团队。该医院的干细胞治疗中心拥有先进的设备和技术，可以为患者提供个性化的治疗方案。
2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：该医院是国内较早开展干细胞治疗的医疗机构之一，拥有一支高水平的科研团队和临床医生队伍。该医院的干细胞治疗中心采用国际领先的技术和方法，为患者提供安全、有效的治疗方案。
3. 中山大学附属第一医院：该医院是国内著名的综合性医院之一，拥有一支由多名知名专家组成的干细胞治疗团队。该医院的干细胞治疗中心采用最新的技术和方法，为患者提供个性化的治疗方案。
以上三家医院都是国内比较知名的干细胞治疗机构，具有较高的专业水平和丰富的经验。当然，选择哪家医院还需要根据患者的具体情况和需求进行综合考虑。