小儿的手指屈肌腱鞘炎，也有人称之为先天性狭窄性腱鞘炎，其病因是A1腱鞘异常增厚导致鞘管狭窄，屈指肌腱于A1腱鞘近端形成一个硬结状膨大，从而导致手指的屈伸功能障碍。但是，该致病原因到底是先天形成的还是后天获得的还存争议。
成人手指屈肌腱鞘炎的病因更多的是与患指劳损有关，由于在短时间内反复屈、伸患指，导致腱鞘组织发生无菌性炎性改变，最终致腱鞘增厚，鞘管狭窄，另一方面，由于劳损或妇女(妊娠或月经期)激素水平的变化，导致手指屈肌腱肿胀，而腱鞘的容积有限，所以，其相对于肿胀的肌腱而言也可形成狭窄性卡压。
除了上述病因外，尚有一些疾病的加重因素，诸如寒冷刺激、糖尿病患者、腱周滑膜炎、类风湿病患者等。