1.类白血病反应 类白血病反应可继发于严重感染、先天性心脏病和转移癌等，这些疾病白细胞增高，但一般不超过50×109/L，中性粒细胞中有中毒颗粒，嗜碱粒细胞缺如，原始和幼稚细胞很少见。中性粒细胞碱性磷酸酶活性增强。细胞遗传学检查正常，无Ph染色体，分子生物学检查BCR/ABL(-)。原发疾病控制后，白细胞数可以恢复正常。
2.Ph 的ALL ACML急性淋巴细胞变与Ph 的ALL进行鉴别，二者融合蛋白的大小不同，ACML通常是210KD，而Ph ALL为185KD，通过反转录PCR的方法检测融合转录的断裂点也有助于鉴别，对治疗的反应也不同。ALL患者经过化疗，完全缓解时Ph染色体消失，染色体核型恢复正常。