蛔虫进入胆道后不一定立即出现并发症，只有当机体抵抗力下降、胆道发生梗阻、胆汁引流不畅时才可能出现并发症。常见并发症如下：
1.胆道感染 化脓性胆管炎，占40%;胆囊炎，占40%;败血性休克，占6%。此时，病人除右上腹绞痛外，常伴寒战、高热、皮肤巩膜黄染、腹胀加剧。查体右上腹压痛范围扩大，并有肌紧张。如出现胆道梗阻，可扪及肿大的胆囊。急性胆囊炎时，墨菲征阳性。
2.胆道出血 出现率为3.5%。常发生于胆道感染的基础上，先有发热、腹痛等，随后出现呕血、黑便。
3.肝脓肿 在肝内胆管炎的基础上，可继发肝炎、肝脓肿。肝脓肿常为多个分散小脓肿，脓肿破溃时，可出现膈下积脓或脓胸。
4.急性胰腺炎 出现率为3.5%。由于蛔虫刺激Oddi括约肌痉挛及虫体堵塞，造成胆汁和胰液引流不畅，使感染的胆汁和(或)胰液逆流入胰管而激活胰酶，引起急性胰腺炎;虫体钻入胰管可引起坏死性胰腺炎;虫卵沉积于胰管引起炎症、纤维化，可致慢性胰腺炎，这是早年我国胰腺炎的一种特殊原因。
5.胆系结石症 发生率约为19%。胆道内的蛔虫残骸碎段或残留角质可作为结石核心，形成结石。此种结石多为胆色素性结石。此外，雌性蛔虫每天产出大量虫卵，也可成为结石核心。
6.其他 胆总管穿孔率约<1%，胆囊穿孔<1%，腹膜炎占6%，脓胸占2%～6%，胆管狭窄占1%～3.5%。
