粪瘘发生的原因基本与尿瘘相同，此外，不少是由于会阴三度裂伤缝合手术失败，或者行会阴切开术缝合时缝线透过肠粘膜所致。小肠、结肠阴道瘘虽较少见，但多由手术损伤或术后粘连所致。