1.一般治疗
脱离变应原是最为理想有效的治疗手段。应尽量避免与可能的变应原接触。如清除房间的破布及毛毯，注意床上卫生，使用杀虫剂消灭房间的虫螨，在花粉传播季节避免接触草地、树花等，停戴或更换优质的接触镜与护理液。眼睑冷敷可以暂时缓解症状。
2.药物治疗
(1)抗组胺药 抗组胺药通常局部使用，常用的滴眼液有0.1%的依美斯汀、0.05%的 Levocabastine、0.1% 的Olopatadine及0.5%的Ketorolac。如果有眼外症状，可以口服使用，不过其效果不如局部用药。常用口服药物有苯海拉明、氯苯那敏、异丙嗪等。抗组胺药与血管收缩剂联合使用，往往可以取得更好的治疗效果如润洁那素达等。
(2)肥大细胞稳定剂 常用的有色甘酸二钠及奈多罗米等。肥大细胞稳定剂的总体治疗效果虽不及抗组胺药，但其对抑制流泪似乎更有效。最好在接触过敏原之前使用。
(3)非甾体类抗炎药 在过敏性疾病发作的急性阶段及间歇阶段均可使用，对缓解眼痒、结膜充血、流泪等眼部症状及体征均显示出一定的治疗效果，它还可以减少激素的使用剂量，常用的有吲哚美辛(双氯芬酸钠)、阿司匹林等。
(4)血管收缩剂 局部使用的常用药物有肾上腺素萘甲唑林、羟甲唑林、四氢唑林等，可改善眼部不适，减轻眼表充血。
(5)糖皮质激素 严重的过敏性结膜炎使用其他药物治疗无效时才考虑使用，且使用时间不宜太长，以免引起白内障、青光眼单胞病毒感染、真菌感染及角膜上皮愈合延迟等并发症。常用的有地塞米松、倍他米松及氟米龙等。
(6)免疫抑制剂 主要有环孢霉素A及FK506对于一些严重的需要使用激素的春季角结膜炎病例，局部应用2%的环孢霉素A可以很快控制局部炎症及减少激素的使用量。但是，在停药后易复发。
3.脱敏治疗
此法主要用于季节性过敏性结膜炎，对于其他亚型的过敏性结膜炎，其治疗效果往往并不理想，因而很少采用。
4.冷冻疗法
此法主要用于春季角结膜炎。冷冻治疗常用于上睑结膜，将温度降至-80℃～-30℃，持续30秒。冷冻治疗可以重复使用2～3次。
5.心理治疗
眼过敏性疾病是一种急性或慢性的反复发作性疾病，彻底根治常常非常困难。因此对一些患者造成较大的心理压力。特别是一些春季角结膜炎的患儿，可能会出现一定的心理障碍，应加以注意。
