1.与急性肾小管坏死鉴别 急性肾小管坏死者无过敏性药物应用史，无过敏反应(或皮疹)的发生，尿液中嗜酸细胞不增高，血中IgE不高或正常可与本病鉴别，如有困难者可通过肾活检鉴别。
2.与急性肾衰竭鉴别 急性肾小球肾炎、急进性肾小球肾炎、原发性肾病综合征、狼疮性肾炎及急性肾小管坏死所致的急性肾衰竭，均具有急性肾衰竭的共同表现及各自原发病的特殊表现，但没有全身变态反应及嗜酸性细胞尿等表现。镓扫描检查在急性间质性肾炎时其肾摄取密度增加，而急性肾小管坏死则不摄取，亦可助鉴别诊断。
3.在原有慢性肾小球疾病出现肾衰竭的鉴别 当出现原因不明的急性肾衰竭或进行性肾衰竭，肾功能下降难以解释时，应警惕急性过敏性间质性肾炎的可能。寻找全身过敏表现如皮疹、血中IgE升高、嗜酸性粒细胞尿等均有助于诊断。必要时肾活检明确诊断。
4.与嗜酸性粒细胞尿鉴别 嗜酸性粒细胞尿也可见于上、下尿路感染、急进性肾炎、IgA肾病、梗阻性肾病、慢性肾衰竭、肾乳头坏死、前列腺炎、急性肾移植后排异和动脉粥样栓塞性疾病。应以各自不同的临床特点来进行鉴别。