1、直肠指检：坐骨直肠窝脓肿可触及该区一侧或两侧隆起，有触痛及波动。若隆起、触痛、波动感位于直肠壁则为括约肌间脓肿。若直肠上段肠壁外两侧有此征时为骨盆直肠间隙脓肿。而直肠后脓肿除直肠后方有此征外，尚有肛门尾骨之间压痛。穿刺可抽得脓液。
2、白细胞及中性粒细胞计数升高。
3、 体检：
1）.骨盆直肠窝脓肿：位于直肠两侧，其上界为腹膜，下界为肛提肌，前方男性为膀胱颈和前列腺，后方为直肠侧韧带。此脓肿早期肛门外无肿块，手指伸入肛内可触到肿块，晚期脓液穿破肛提肌后，在肛外迅速形成较大脓肿。
2）.直肠后脓肿：位于直肠和骶骨之间，上界为腹膜，下界为肛尾韧带，两侧为直肠侧韧带。早期肛外亦无肿块，手指伸入肛内后在骶骨前可触到肿块，晚期脓液窜过骶尾韧带旁，脓液同时或先后进入肛外皮下，在肛外左后或右后形成脓肿，破溃后形成为马蹄形肛瘘。
3）.粘膜下脓肿：位于肛门齿线以上的粘膜下，表面为直肠粘膜，里为肛门内括约肌或直肠环肌，无明显的上下界线。肛内指检在粘膜下可触及表浅之肿块，此种脓肿不易窜到肛外，而在粘膜破溃后成为内盲瘘。
4）坐骨直肠窝脓肿：位于肛提肌下方，坐骨和直肠之间，为浅部脓肿之较大者、检查时可见：(1)肛门两侧不对称，一侧稍高突，皮肤不红，但灼热，可有较大范围的触痛区，早期较硬，难以发现波动感;(2)指诊发现有触痛包块，相当于一侧坐骨间隙，其上端在肛直肠环平面以上。
5）.肛周皮下脓肿和肛门后脓肿：检查可见肛门一侧有一界限不明显的微红色突起包块，触痛明显，此脓肿易于破溃，溃后形成浅部肛瘘。
