对本病的治疗最主要是进行抗感染治疗：
1、早期抗生素的选择需根据年龄，过去史，关节外感染灶，并结合滑液的革兰氏染色结果确定。一旦得到培养结果(24~48小时)和敏感性实验结果(3~4天)，应调整抗生素用药。
2、在怀疑为非淋球菌的革兰氏阳性菌感染时，应首选半合成青霉素(优福星)，先锋霉素，万古霉素(如果细菌耐药，如金黄葡萄球菌)或氯林可霉素。疑为革兰氏阴性菌感染时，可用第三代先锋霉素和氨基糖苷类药物(感染严重时)以非肠道给药的方式给药直至药敏试验示有结果时。
3、非肠道给药至出现明显疗效(约2周)，然后需口服维持剂量的抗生素约2~6周后临床症状会有改善。链球菌和嗜血杆菌感染2周即可根除。葡萄球菌感染至少需3周通常是6周或更长的时间，特别是有过关节炎病史的患者。
4、除了应用抗生素，急性非淋球菌关节炎每天要至少一次用大号针头抽取关节脓液，定时冲冼，关节内镜冲洗或关节手术清创。风湿性关节炎也应尽早进行手术清创引流。关节在最初几天内可以上夹板以缓解疼痛，待好转后可进行主动的运动训练。
5、播散性淋球菌感染的治疗相同，与病期无关。临床经验表明因淋球菌耐药性的不断变化应及时改变治疗方案。播散性淋球菌感染不需要手术清创和引流，一般不会造成永久性的关节损伤。若同时存在沙眼衣原体引起的生殖系统感染(50%)，应积极治疗，并且避免与患者有性接触(参见第164节)。
6、置换关节的感染需接受长期治疗。它包括：
(1)对不能手术的患者应长期服用抗生素;
(2)伴有或不伴有关节融合的切除关节成形术(感染未控制的患者或骨储备不充分者);
(3)手术摘除置换关节，仔细清除骨质和失活组织，长期服用抗生素;
(4)立即或延期(1~3个月)植入新的经抗生素处理的关节。但无论是立即或是经2~3个月的抗生素治疗后的关节移植，仍有38%的感染复发率。
7、人咬后可以用阿莫西林或甲硝唑治疗3~5天。动物咬后感染P。multocida用青霉素治疗有效，但关节感染应采用外科清创术。鼠咬后感染S。monili-formis或S。minus用青霉素治疗亦有效。
8、对于病毒性关节炎无特殊疗效。分枝杆菌和真菌引起的关节感染需长期治疗，可联合应用多种抗生素，并根据微生物的药物敏感性进行调整。