FLC应与普通型的肝细胞肝癌(表1)、肝局灶性结节性增生、肝腺瘤及转移性肝癌相鉴别。
肝脏局灶性结节性增生诊断较困难，但影像学检查可帮助与FLC鉴别。局灶性结节性增生的超声、CT均可发现肝占位，但核素显像提示摄取过度或正常摄取，而FLC则为放射性缺损。肝腺瘤主要见于有口服避孕药史的育龄妇女。99mTc-PMT延迟显像提示肝腺瘤呈强阳性。病理检查可作出明确诊断。但FLC的鉴别诊断有时较困难。尚须借助电镜和组织化学染色来进一步明确诊断。继发性肝癌有原发癌病史或证据.超声图像上主要表现为多个类圆形病灶，肿块较小时低回声多见，肿块大时则多为高回声。CT图像上表现为多个类圆形或不规则的低密度病灶。