湄公血吸虫雌虫长12～23mm。卵巢与卵膜位于中部1/5处。子宫内含虫卵。虫卵正圆形，直径40～45μm。卵壳一侧近末端有一小结。雄虫长15～40mm，有7个睾丸。抱雌沟从头部延伸至末端。体表多刺状突起。湄公血吸虫寄生在肠系膜静脉内。生活史与日本血吸虫相似，但有下列不同：①虫卵较小，正圆形;②螺中间宿主为新拟钉螺属(Neotricula)的开放拟钉螺，为3mm×2mm小螺，在水中生活，不是水陆两栖;③从尾蚴感染至成虫产卵的潜伏期较长，小鼠为35天;狗与仓鼠为43～49天，而日本血吸虫在小鼠体内产卵为20～26天，家兔对湄公血吸虫不易感。
新拟钉螺分为α，β与γ三种。传播媒介以γ种为主，螺壳上有3个大黑点，故又名虎纹螺。湄公河雨季水位高时，该螺吸附在河底石块下;在旱季水位低时则大量滋生在河道浅水中，吸附在石块、岩石与树枝上。尾蚴从螺体逸出，尤其早晨为多。