应与以下疾病鉴别：乙肝肾炎、艾滋病肾病、肾淀粉样变、感染性心内膜炎及败血症肾损害等。鉴别早期的HIV-AN和HAN常常是很困难的，与肝炎病毒性肾小球肾炎的鉴别点主要包括患者血内有肝炎病毒感染的标志、肾活检组织有肝炎病毒抗原的标记。肾淀粉样变的患者常常有长期皮肤感染、溃疡的病史，刚果红、硫碘素T等特殊染色为阳性。感染性心内膜炎、败血症所致的肾损害常有原发疾病的临床表现作鉴别。