治疗首先应在维持血压、纠正休克基础上，根据年龄、季节特点，有针对性地选择易透过血-脑脊液屏障的有效抗生素，然后根据细菌培养和药敏实验结果调整抗菌药物。
1.在儿童与成人，三代头孢是治疗3种常见的化脓性脑膜炎的首选药物。其中头孢曲松(头孢三嗪)、头孢噻肟和头孢呋辛(头孢呋肟)效果较好。对怀疑有利斯特菌脑膜炎的患者，加用氨苄青霉素，对青霉素严重过敏和先前已用过头孢菌素者，选择氯霉素较为合适。
2.对于新生儿，其致病菌可能为无乳链球菌、大肠埃希杆菌和单核细胞增多性利斯特菌，首选氨苄西林(氨苄青霉素)加头孢曲松(头孢三嗪)或头孢噻肟，也可选用氨苄西林(氨苄青霉素)加氨基糖甙类抗生素，但要警惕听力或前庭功能受到损害。
3.对于那些免疫功能受损、神经外科手术后脑室引流或严重颅脑外伤引发的脑膜炎病例，由于葡萄球菌或革兰阴性杆菌，特别是铜绿假单胞菌，致病的可能性很大，应使用头孢他啶(头孢他定)和万古霉素。
4.上述药物一般均采用静脉给药途径，以期有较高的血药浓度和脑脊液药物浓度。使用抗生素药物的时间一般为10～14天。无并发症者早期给予适当治疗，可在1至数天内清除脑脊液中的病原菌，有并发症者相应延长。
5.在应用抗生素的同时，对于儿童患者应加用地塞米松，静脉滴注，连用3～5天，可以减少儿童的听力受损及其他神经系统后遗症的发生率。
6.对于暴发性感染的成人患者，如伴有颅内高压、严重菌血症及急性肾上腺功能不全，也应使用皮质类固醇激素。地塞米松静脉滴注，连用3～5天。
7.对于发病初期，有颅内压增高伴严重脑肿胀者，应用20%甘露醇静脉快速滴注及速尿静脉推注。
8.出现痫性发作者应给予抗惊厥药物。
9.儿童应注意避免低钠血症和水中毒此乃导致脑水肿的诱因。
