本病无特效疗法，一般采用对症治疗，以补充丢失的HCO3-中和内生酸性物质。
1.病因治疗
治疗原发疾病如多发性骨髓瘤、肾病综合征、肾小管间质性疾病等。
2.纠正酸中毒
轻症者可暂不服药，随访观察。症状明显时予以碱剂治疗，常用碳酸氢钠。由于服药后血中HCO3-浓度增高，尿中HCO3-排量也增加，故常需大剂量多次投药，可分次口服。
由于PRTA对补碱有一定抵抗性，因此碱性药物多2～3倍于DRTA时的剂量。但应用大剂量钠盐时，肾小管Na+-K+交换增加，会加重失钾，甚至严重失钾。因此要同时补钾并要低盐(氯化钠)饮食，以减少高氯酸中毒和失钾，限钠入量也减少尿HC03-的排泄。因此症多见于婴幼儿，儿童补HCO3-的量大约10mmol/(kg·d)，此后以维持血中HCO3-浓度于正常范围而调整剂量。
也可应用枸橼酸盐缓冲液：枸橼酸钠、枸橼酸钾、枸橼酸，加水至1000毫升，口服治疗。
3.补钾
轻症一般无须给钾盐，但重症或使用利尿药时必须给钾。因利尿药可使症状改善和尿量减少，而不能使血浆HCO3-浓度恢复正常,失钾却见增加。补钾常用枸橼酸钾合剂。
4.利尿药应用
当不能耐受大剂量碳酸氢盐或重症时，单独用碱盐难以奏效，补给的碱盐迅速经尿排出，补的多丢失亦多，酸中毒不易纠正，即需合用利尿药。
诸利尿药中氢氯噻嗪(双氢克尿塞)最有效,髓襻利尿药如呋塞米、依他尼酸(利尿酸)、布美他尼(丁尿胺)等使尿钙排泄增加，不能提高血浆HCO3-浓度，Ⅱ型PRTA禁忌使用。
5.补钙及维生素D
对有骨损害(一般较轻)如骨质疏松、骨软化者应补充钙剂，维生素D、蛋白合成剂等。Ⅱ型近端小管磷重吸收有缺陷，尿磷丢失，若血磷低，每天补磷1～3克。
磷酸盐合剂配方：磷酸二氢钠(NaH2PO4)、磷酸氢二钠(Na2H2PO4)，加水溶解至1000毫升(每毫升含20mg磷)口服。注意剂量大时可引起呕吐腹部不适、腹泻等，缓慢增加剂量多数患者多能耐受。若长期服用磷盐治疗可能会发生高磷血症、继发甲旁亢，应监测血清磷水平并维持在1～1.3mmol/L。