中医认为，慢性萎缩性胃炎肠化生是由于瘀、浊、毒、痰等病理因素造成的。因此对慢性萎缩性胃炎肠化生的治疗大法也主要是针对上述病理因素而设，或活血、或化浊、或解毒、或化痰等。此外，不同的病理因素也有可能相兼而致病，故而不同的治疗大法常相互配合，协同使用。

1、气滞血瘀

中医认为人体之气能够推动血液的运行，当气机运动受阻时，则无法推动血液的正常运行，导致血液停滞成瘀，此即中医所说的“气行则血行，气停则血停”。气滞、血瘀停滞于胃腑，日久则酿生癥瘕肿块，由此导致肠化生甚至胃癌的发生。对于气滞血瘀型的慢性萎缩性胃炎伴肠化生的患者，治疗上应该行气、活血、化瘀，可辨证选用丹参饮或血腑逐瘀汤进行治疗。

2、痰浊内阻

随着社会经济的发展和生活水平的提高，现代人的饮食结构中，肉、蛋、油类食品的比重越来越高，高蛋白、高脂肪及高糖分的摄入过量，导致血糖、血脂飙升。中医认为，血液中过剩的血脂和血糖可以归为痰浊的范畴。血脂和血糖长时间过高，导致痰浊内盛，因而痰浊互结，内阻于胃腑，最终酿生癥瘕肿块，导致肠化生的发生。对于痰浊内阻型的慢性萎缩性胃炎伴肠化生的患者，首先应该调整饮食结构，减少高糖、高蛋白、高脂肪类食物的摄入，并辅之以化痰祛浊类的中药进行治疗，常用的方药有导痰丸、六君子汤等。

目前对于慢性萎缩性胃炎伴肠化生的治疗，西医暂无特效药物，一般建议定期胃镜观察和随访。而中医药在慢性萎缩性胃炎伴肠化生的治疗上有独特的优势。临床研究表明，中药辨证治疗能够有效改善慢性萎缩性胃炎的临床症状，同时能够逆转肠化生，从而降低胃癌发生率。