肉孢子虫囊呈援圆柱形或纺锤形，大小差别很大;长径1～5cm，横径0.1～1cm，囊壁内有许多间隔把囊内虫体— 缓殖子分隔成簇。成熟卵囊长椭圆形，内含2个孢子囊，因囊壁膜而脆弱，常在肠内自行破裂，孢子囊即脱出。孢子囊呈现椭圆形或卵圆形，壁双层而透明，内含4 个子孢子，大小为13.6～16.4μm×8.3～10.6μm。人肉孢子虫的孢子囊较猪人肉孢子虫的孢子囊稍大。
人和猕猴、黑猩猩等食肉类动物为忙棒肉孢子虫的终宿主，牛、无、分别为人肉孢子虫和猪肉孢子虫的中间宿主。终宿主分辨中的孢子让或蓝囊被中间宿主(食草类)食入后，德保子带其小肠内逸出，穿过肠壁进入血液，在多数其滚的血管壁内皮细胞中形成裂殖体，进行几代裂体增殖后，裂殖子进入肌肉组织中发育为肉孢子虫囊，横纹肌及心肌多见。肉孢子虫内字样母细胞或称木细胞增殖生成缓殖子。中间宿主肌肉中的肉孢子虫囊被终宿主吞食后，缓殖子释出并侵入小肠固有层，无需经过裂体增殖就直接形成配子，雌雄配子结合成为卵囊，卵囊在小肠固有层逐渐发育成熟。人肌肉肉孢子虫的中间宿主为人，其终宿主可能是食肉类哺乳动物、猛禽或爬行类。