男性更年期综合症的发生机理至今尚不清楚，大多数学者认为男女更年期发生的机理相似。在男性主要由于睾丸的萎缩、睾丸酮的分泌减少，反馈刺激垂体的分泌功能增加，萎缩的睾丸对促性腺激素的反应降低，使体内性激素的调节功能失衡。