本病潜伏期长短不一，可数天至2～3个月不等，临床可分为急性期、慢性期和异位损害。
1.急性期
主要由幼虫在腹腔及肝脏移行所产生的症状，如合并有细菌感染可导致严重的后果。此期症状体征并不完全相同，主要有不规则发热(38～40℃)、右下腹痛、食欲缺乏、腹胀、腹泻或便秘。尚可有咳嗽胸痛、右胸闻及湿性啰音及胸膜摩擦音等。多数有肝大少数伴有脾大及腹水。上述症状可持续4个月左右而消退并逐渐进入慢性期。
2.慢性期
当急性症状消退后可数月或数年无明显不适，亦可在此期某些症状再次出现如腹痛、腹泻、不规则发热以及反复荨麻疹、黄疸、贫血、低清蛋白高免疫球蛋白血症。后两者是因虫体寄生的胆管上皮损伤、糜烂及成虫食血(每条使宿主失血约0.5ml/d所致)由于成虫引起的胆管慢性炎症和增生，造成胆管纤维化以致肝硬化，亦可因成虫或胆管结石形成使胆管阻塞引起阻塞性黄疸，进而发展成为胆汁性肝硬化。
3.异位损害
又称肝外肝片吸虫病。幼虫在腹腔中移行穿入或被血流带至肝脏以外的脏器和组织，如腹壁肌肉等引起病变。中东个别地区人群有吃生羊肝的习惯，寄生在羊肝胆管的虫体可侵入人的咽部，引起局部水肿及充血，出现吞咽及呼吸困难，耳聋及窒息等，即咽部肝片吸虫病。