常见并发症与妇科宫颈炎、盆腔炎同时发生，也常与滴虫性阴道炎同时发生。在妊娠期细菌性阴道病可引起不良围产期结局，如绒毛膜羊膜炎、羊水感染、胎膜早破、早产及剖宫产后或阴道产后子宫内膜感染等。
1.盆腔炎
有盆腔炎的女性生殖道分泌物中，最常分离出的菌群与BV的菌群一致，包括拟杆菌属、消化链球菌数、阴道加特纳菌等。
2.异常子宫出血和子宫内膜炎
异常子宫出血由子宫内膜炎所致，子宫异常出血由感染的子宫内膜对卵巢激素的异常反应或由子宫内膜受到感染或炎症的直接破坏所致。
3.妇科术后感染
在手术终止妊娠的女性中，妊娠合并BV女性的盆腔炎发病率是未合并BV女性者的3.7倍。
4.宫颈癌
BV、宫颈上皮内瘤样及生殖道人类乳头状瘤病毒感染有着相同的流行病学关系，BV的厌氧菌代谢产生了阴道分泌物中的氨及有致癌作用的亚硝酸氨。
5.HIV感染
BV患者可增加HIV传播的危险性。当PH升高时，HIV的生存能力和粘附能力也增加，并且可能使传播更为容易。
6.不孕和流产
BV患者输卵管因素不孕症发生率增高。在助孕治疗中，BV患者和非BV患者胚胎种植率相似，但BV患者的早孕期流产率高于非BV者。
