肝脾肿大并发症视原发病不同而不同。如新生儿感染性疾病引起的肝脾肿大疾病，可并发新生儿败血症、化脓性脑膜炎、肺炎、肺脓肿、迁移性病灶(如蜂窝组织炎、骨髓炎，肾盂肾炎等)和多脏器功能障碍综合征等。