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同其他先天性心脏病一样,可能因妊娠早期母亲因风疹等病毒感染,营养不良,子宫受到某些物理、化学的影响和遗传因素等,使胚胎时期心肌局部区域发育停止,窦状隙持久存在,使冠状动脉与心腔直接交通,形成了冠状动脉瘘。