与扁桃体炎鉴别
急性扁桃体炎的咽痛及全身症状均比急性咽炎严重，检查可见扁桃体红肿化脓，咽部粘膜虽受影响，但淋巴滤泡无化脓表现。
与咽白喉相鉴别
咽白喉全身中毒症状明显，精神萎靡，咽部可见灰白色假膜，取分泌物检查可找到白喉杆菌。
与食道癌的鉴别
1、食管癌早期与慢性咽炎均可出现咽部不适的症状，但食管癌早期尚未出现吞咽困难时的咽部不适症状多表现为咽部干燥、紧缩感并常有胸骨后压迫、闷胀感和嗳气等;而慢性咽炎是咽部粘膜的慢性炎症，其咽部不适主要是干燥、瘙痒、灼热感等，并且这些症状可导致患者频繁的咳嗽。
2、食管癌与咽炎都有咽喉部的异物感，但慢性型咽炎的咽喉异物感在安静时明显，在进食时减轻或消失，进食后又出现，且进食时没有阻挡感;而食管癌则是在吞咽时有异物感并且常伴胸骨后痛、烧灼感等。
