就目前而言，对于乙肝肾炎尚未无特效的治疗方法。免疫抑制剂虽然对多种类型肾小球肾炎有益，但可能延缓缩主清除乙型肝炎病毒的能力，因此多数人不主张激素治疗。干扰素有抗病毒作用，通过与细胞表面受体异性结合，激活某些酶以后阻断病毒的繁殖与复制，但不能进入宿主细胞直接杀灭病毒。阿糖腺苷能抑制DNA多聚酶和核苷酸还原酶，从而抑制病毒的复制，如果联合应用干扰素治疗，可获得更好的效果。此外，清热利湿、活血化瘀、益气健脾的中药对调节机体免疫功能，抑制和杀灭乙型肝炎病毒，也有一定的疗效。
乙肝肾炎患者如在乙型肝炎活动期应该隔离，患者应增强自信心，克服焦躁忧伤情绪，让身体慢慢增强抵抗力，去战胜疾病。