隐匿性肾小球肾炎可以通过尿常规、肾功能、肾脏病理学、尿相差显微镜等方法来确诊。

1、尿常规

尿常规检查包括理化、生化、尿沉渣、尿液外观等项目，这些检查是早期发现与诊断肾脏类疾病的重要线索，但是尿常规检查大多是定性结果，常常需要跟其他更为敏感、精确的检查还能确诊。另外要注意的是，尿液需尽量采取新鲜清洁的，并要尽量避免放置时间过长与污染。

2、肾功能

肾功能检查是肾脏类疾病中的常规检查项目，其中的血肌酐检测是临床对肾小球滤过功能进行评估的常用法，检测的速度快且简便，但是具有较低敏感性、无法反映早期肾脏损害等缺点。另外，血肌酐只有在患者肾小球滤过功能的损害达到50%后才开始升高。

3、肾脏病理学

肾脏病理学是一种有创检查，其病理学标本大多来自于经皮肾脏穿刺手术，对于多种类型肾病的病情评估、诊断、预后判断、后续治疗指导有非常高的价值。

4、尿相差显微镜

尿相差显微镜主要用来判断患者尿液当中红细胞的来源，例如红细胞形态发生改变，棘形红细胞大于5%或者是尿液中红细胞主要是变异型的，那么可判断肾小球源性血尿。