1、继发感染 这是假性囊肿最常见也是最严重的并发症。病人病情迅速恶化，出现严重毒血症，此时如不及时手术，往往迅速发展为胰腺脓肿和脓毒血症，几乎无例为地导致死亡。
2、胰性腹水 假性囊肿内胰液从瘘管或裂口漏入腹腔，刺激腹膜可引起腹水。胰腺周围淋巴管堵塞致淋巴外渗，也可引起腹水。正常腹膜能吸收大量液体，但在胰性腹水时由于纤维素渗出，纤维组织增生，炎性细胞浸润和弹性纤维变性等病变，液体不能大量地被吸收，而积聚于腹腔内。
3、胰性胸水 约有50%的胰性胸水与胰假性囊肿并存。囊肿内胰液如通过横膈之淋巴管，弥散入胸腔，刺激胸膜或囊肿与胸腔之间形成瘘管，即可引起胸水。胸水多在左侧。
4、出血 出血是假性囊肿罕见的但最危险的并发症。出血可以由于：①假性囊肿内血管破溃;②囊肿侵及胃肠道壁;③并发门脉或脾静脉梗阻而发生食道静脉曲张破裂;④囊肿侵及胆道而出血;⑤假性动脉瘤破裂。在囊内出血时，囊肿急剧增大，并可听到血流声。故凡囊肿突然增大并有全身失血征象，应及时动脉造影检查，此时常需急症手术，包括囊肿摘除术或打开囊肿结扎出血的血管，并作囊肿引流。
5、脾脏受累 胰假性囊肿患者可同时有脾受累，可能由于：①胰假性囊肿侵蚀脾;②从囊肿溢出的胰液对脾的消化作用;③脾内移位胰腺组织发生炎症;④并发脾静脉血栓形成，脾内梗死区的液化。在此种情况，应早期作脾脏切除术，并尽可能同时作远端胰腺切除术。
6、囊肿破裂和穿孔 胰假性囊肿可自发穿孔或破入邻近的内脏，常并发胃肠道出血。胰腺假性囊肿破入胃、十二指肠、结肠等不一定有症状，此时对病人不一定有危险，相反能提供有效的引流。但如囊肿破入腹腔，则死亡率极高。在此情况下，病人常有休克，死亡率18%～80%。
7、其他 ①黄疸：由于假性囊肿压迫胆总管可引起梗阻性黄疸。②腹泻：假性胰腺囊肿有时可引起严重腹泻。
