牙周组织炎症消退后的萎缩，形成萎缩性牙周炎；随年龄的增长，牙龈可出现生理性退缩，即产生老年性萎缩；还有一种病因不明的早老性萎缩，即没有达到高龄而出现全口牙周组织均匀地退缩；由于牙周组织长期遭受机械刺激，可造成机械性的牙周萎缩，常见的机械刺激如刷牙不当、牙膏颗粒太粗、修复体设计不良压迫龈缘、牙周手术后等；当牙齿没有对牙合功能，如错位牙、对颌牙缺失未及时修复、偏侧咀嚼等，牙周组织缺少必要的生理刺激，可使牙周膜变窄、牙槽骨疏松，而出现废用性牙周萎缩。
多数成年人都患有牙周病，大多数牙周病进展缓慢，始发时多为牙周炎，除偶有刷牙出血外并无多少自觉症状，所以不引人注意。而牙周炎发展到一定程度即为牙周炎，此时可出现严重口腔异味，牙周反复脓肿，牙齿松动，牙缝越来越大，越来越稀疏，严重者牙齿脱落。患者若在此阶段就诊，医生可以控制炎症恶化，但已破坏的牙周组织（包括牙周萎缩）是不可逆的，很难完全恢复。刷牙不当不正确的方法不但不能保护还会破坏牙齿及牙周组织，如过硬的牙刷、牙膏中摩擦剂颗粒过粗及拉锯式刷牙，都可能导致牙周退缩。
不良修复体做得不好的假牙不易清洁，会导致牙周卫生不良，也会使牙周萎缩。当组织、器官或细胞成分在达到正常成熟之后，又减退、缩小，并失去其应有的功能称为萎缩。牙周萎缩指的是全口广泛的牙齿牙龈缘与牙槽骨同时退缩，使牙根暴露，但无明显炎症和创伤者。其最常见的原因是牙周组织受到逐渐积累起来的各种损伤、刺激后造成的。