阴茎上长小疮可能是局部卫生不佳、细菌感染、真菌感染、病毒感染、接触性皮炎等因素，需要针对病因治疗，可采取的方法有局部清洁、抗感染治疗、避免接触过敏原等。
1.局部卫生不佳：长期不注意阴茎局部清洁，包皮垢堆积刺激皮肤黏膜可引发小疮，治疗上需每日用温水清洗局部，保持干燥，遵医嘱用药如红霉素软膏外用、莫匹罗星软膏外用，若存在包皮过长反复刺激可待炎症控制后考虑包皮环切术，日常需勤换棉质内裤，避免紧身衣物摩擦。
2.细菌感染：常见金黄色葡萄球菌、链球菌等感染引发毛囊炎或疖肿，表现为红色丘疹、脓疱，治疗需遵医嘱用药如头孢克洛胶囊口服、夫西地酸乳膏外用，若形成脓肿需及时就医切开引流，治疗期间避免性生活，防止交叉感染。
3.真菌感染：多由白色念珠菌感染引起，常伴瘙痒、红斑及白色鳞屑，治疗需遵医嘱用药如伊曲康唑胶囊口服、克霉唑乳膏外用，需注意伴侣同时检查治疗，避免重复感染，保持局部通风透气，避免长期使用广谱抗生素。
4.病毒感染：单纯疱疹病毒HSV感染可引发生殖器疱疹，表现为簇集性小水疱后破溃成疮，治疗需遵医嘱用药如阿昔洛韦片口服、喷昔洛韦乳膏外用，需注意休息，增强免疫力，避免劳累，该病易复发，需定期复查。
5.接触性皮炎：接触避孕套、润滑剂、化纤衣物等过敏原后引发，表现为红斑、丘疹伴瘙痒，治疗需立即脱离过敏原，遵医嘱用药如氯雷他定片口服、丁酸氢化可的松乳膏外用，避免再次接触可疑过敏原，保持局部清洁无刺激。
日常需保持阴茎局部清洁干燥，选择宽松棉质内裤，避免不洁性生活，若小疮持续不愈或加重需及时就医，切勿自行挤压或滥用药物，治疗期间严格遵循医嘱完成足疗程用药，防止病情反复或扩散。