性功能障碍勃起困难主要可对症采用一些药物来治疗，如枸橼酸西地那非、盐酸他达拉非，还有一些调节性欲的药物，如雄激素、三磷腺苷、谷维素等。具体可根据性功能障碍的原因来选择。
1.改善阴茎勃起障碍的药物
阴茎勃起障碍者可选择5型磷酸二酯酶抑制剂来治疗，能改善患者阴茎勃起异常。常用药有枸橼酸西地那非、盐酸他达拉非、盐酸伐地那非等。
2.性欲调节药物
其中雄激素是最常见的调节性欲的药物，可增加患者的性欲。另外还有三磷腺苷、谷维素等中枢神经调节药也可调节性欲。
3.三环类抗抑郁药物
如果是心理因素引起的性功能障碍，可采用三环类的抗抑郁药治疗，如丙米嗪、阿米替林、多虑平、氯米帕明等。
4.治早泄的药物
因早泄而出现勃起困难的，可服用选择性5-羟色胺再摄取抑制剂或是5型磷酸二酯酶等药物，还可配合外用利多卡因喷雾剂，这样可以降低阴茎敏感度，更好的控制射精。
5.手术治疗
如果是重度性功能障碍者，可行阴茎假体植入术。对早泄引起的性功能障碍，可选择包皮成形术、阴茎头填充增粗术等来改善。