精子碎片率50%但怀孕了，这种情况可能是精索静脉曲张、生殖系统感染、不良生活习惯、环境因素、年龄因素等影响，需要针对病因治疗，可采取的方法有药物治疗、手术治疗、改善生活方式等。
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张可能导致精子碎片率升高。轻度患者可采取保守治疗，如遵医嘱用药迈之灵片、地奥司明片等；严重者可能需要手术治疗。
2.生殖系统感染：如附睾炎、精囊炎等生殖系统感染也会影响精子质量。治疗时需根据感染类型选择合适的抗生素，如遵医嘱用左氧氟沙星胶囊、头孢克肟分散片等。
3.不良生活习惯：长期吸烟、酗酒、熬夜等不良生活习惯会对精子产生损害。应戒烟戒酒，保持规律作息，适当运动。
4.环境因素：长期接触有害物质，如农药、重金属等，可能影响精子质量。应尽量避免接触此类物质。
5.年龄因素：随着年龄增长，精子质量可能会下降。这种情况需要注意保持健康的生活方式，以维持精子的质量。
如果精子碎片率高但已经怀孕，应及时到医院进行检查，密切关注胎儿的发育情况。同时，孕妇要保持良好的心态，注意休息，合理饮食，为胎儿的健康成长创造良好的条件。