非淋菌性尿道炎假阴性是指在进行尿道炎检查时，检查结果呈阴性，但实际上患者却患有非淋菌性尿道炎。这种情况的发生可能是由于以下原因：
1. 检测方法不准确：由于检测方法不准确或操作不当，导致检测结果出现误差。
2. 病原体特殊：由于病原体特殊，导致检测方法无法准确检测出病原体。
3. 疾病症状不明显：由于疾病症状不明显，导致患者没有及时进行检查和治疗，从而影响检查结果。
4. 样本采集不当：由于样本采集不当，导致病原体没有被提取出来，从而影响检查结果。
总之，非淋菌性尿道炎假阴性是由于多种因素引起的，需要及时就医进行准确诊断和治疗。