拉肚子时是否可以吃黄连素和阿莫西林胶囊，需要根据具体情况来判断。
首先，黄连素是一种中成药，具有清热燥湿、行气止痛、止痢止泻的作用，对于因湿热蕴结所致的腹泻有一定的治疗效果。如果拉肚子是由于饮食不洁或腹部受凉引起的急性胃肠炎，且症状较轻，没有发热、脓血便等严重情况，可以在医生指导下服用黄连素来缓解症状。
然而，阿莫西林胶囊是一种抗生素，主要用于治疗细菌感染。如果拉肚子是由细菌感染引起的，如细菌性痢疾等，在明确病因后，可以在医生指导下使用阿莫西林胶囊进行抗感染治疗。但如果拉肚子的原因不是细菌感染，而是病毒感染、食物中毒或其他非感染性因素，那么使用阿莫西林胶囊可能无效，甚至可能加重肠道菌群失调，导致病情恶化。
此外，即使拉肚子是由细菌感染引起的，也不能自行随意使用阿莫西林胶囊。因为不同的细菌对抗生素的敏感性不同，而且抗生素的使用需要遵循一定的剂量和疗程，否则可能导致耐药菌的产生或药物不良反应的发生。
因此，拉肚子时是否可以吃黄连素和阿莫西林胶囊，需要根据具体的病因和病情来判断。建议及时就医，进行相关检查，明确病因后在医生指导下进行治疗。同时，在治疗期间要注意饮食卫生，避免进食生冷、油腻、刺激性食物，以免加重病情。