治疗灰指甲的方法很多，灰指甲大部分是由真菌引起的，治疗灰指甲的药物都是能够消灭指甲真菌的，目前所采用的主要药物和方式是手术拔除指甲、内服药物和外用药物、中医治疗灰指甲。
治疗灰指甲的药物之内服药：
主要有酮康唑，疗程长，治愈率还可以，治疗灰指甲的口服药以前作为灰指甲的治疗主要手段，不过因为国内国外发生口服治疗灰指甲致患者死亡的案例，现在已经严禁口服这种药物治疗灰指甲；还有灰黄霉素，但是因为疗程长治愈率低，毒副作用大，现在基本停止使用了；这些方法不宜作为灰指甲的常规治疗药物
甲真菌病仍以皮肤癣菌最常见，约为77.6%，以红色毛癣菌为主(85%)，其次为须癣毛癣菌(12%)、絮状表皮癣菌(2%～3%)。其分解的角蛋白，产生侵袭性酶并入侵和破坏正常组织，导致原发性甲感染。继发性甲感染发生于其他因素损害甲后，多由无分解角蛋白能力的酵母菌和真菌引起。酵母菌中，以念珠菌属为主约占20%左右，其他真菌主要有青霉属和曲霉属，还有白地霉、帚霉属及毛霉属、柱顶孢霉等。有人提出，该病是一种角蛋白变异有关的常染色体显性遗传疾病，部分人群有此遗传素质。
灰指甲是由真菌感染引起的，真菌引起的甲病可以出现多种颜色，最常见的是灰白色，还可见到褐色、灰褐色或深褐色，黑黑黄黄的指甲丑陋不堪。同时可见到甲板增厚、变脆，起层，糟碎，或甲板中层蛀空，或甲缘参差不齐，或甲板残缺不全，没有光泽变色等，影响人的交际和正常生活。夏天来拉，爱漂亮的女孩子的烦恼随之也就来了，喜欢夏天穿各式各样的凉鞋，但患了灰趾甲后，不得不想各种方法（穿着布鞋或是穿上不透明的袜子等等）来遮掩住，大大影响自己美丽的心情。
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