非淋菌性尿道炎本身是不会引起发烧现象的。不过如果非淋菌性尿道炎引起其它并发症时，则可引起发烧现象。如当非淋菌性尿道炎继发性细菌感染时，严重的就可导致局部红肿、化脓、疼痛，并出现发热等全身不适症状。而一般没出现并发症时，非淋菌性尿道炎主要会出现尿道刺痒，尿急尿痛等症状。
一、男性非淋菌性尿道炎症状
主要会出现尿道刺痒红肿及排尿疼痛的症状，有时尿道口还会出现少量黏性分泌物。除此之外，还会有尿急、尿痛及排尿困难的现象，炎症严重时尿道分泌物会明显增多，尤其晨起可在尿道口发现有血痂或导致内裤污秽。
二、女性非淋菌性尿道炎症状
女性非淋菌性尿道炎多数症状不明显，少数患者的宫颈会有黏液和脓性的分泌物，并有明显的黏液脓性宫颈炎，还有的患者会出现急性盆腔炎及不育等症状。
三、其他症状
非淋菌性尿道炎患者有部分会出现性交痛，当因口与生殖器接触引起咽部感染后累及生殖系统时，则可引起宫外孕、不育症，甚至可导致肝周围炎。
