一般软下疳要做细菌培养检查、聚合酶链反应检测、病理学检查等，而淋巴肉芽肿需进行补体结合试验、病原体培养、活体组织检查等。由于软下疳和淋巴肉芽肿是两种不同的疾病，所以检查方法也存在一定差异。
1、软下疳的检查方法
（1）细菌培养检查：通过采集分泌物、血液等标本，利用培养基来进行细菌培养，有助于细菌种类的鉴定，是软下疳的常用检查方式。
（2）聚合酶链反应检测：此检测方法常被简称为PCR，是一种分子生物学技术，若在检查过程中显示杜克雷嗜血杆菌阳性，即可诊断为软下疳。
（3）病理学检查：符合软下疳溃疡组织病理表现的患者，要及时去医院进行病理切片检查，有可能找到杜克雷嗜血杆菌。
2、淋巴肉芽肿的检查方法
（1）补体结合试验：属于血清学诊断方法，可以检测出两种抗体，包括砂眼衣原体抗体、鹦鹉热衣原体抗体，对诊断淋巴肉芽肿有很大帮助。
（2）病原体培养：取肿大的淋巴结穿刺物进行组织细胞培养，若培养结果显示阳性，就要引起重视，很有可是淋巴肉芽肿引起的。
（3）活体组织检查：在病变部位取少量组织进行活检，并观察其病理变化，有助于确诊淋巴肉芽肿。
