生殖器疱疹上火，可以使用清热解毒类的药物，以及抗病毒药物、止痛类药物治疗，如果病情较为严重，配合物理治疗等方法同步进行，效果会更好。另外在治疗期间注意做好日常的各项防护工作，避免病情传染给别人。
1、清热解毒类的药物：比如牛黄解毒片、银翘解毒丸、蓝芩口服液、蒲地蓝消炎口服液等，都可以改善身体上火内热等异常情况，避免病毒的持续性复制。
2、抗病毒药物：包括阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等，具有抑制病毒复制的功效，对于生殖器疱疹的治疗效果也很明显。
3、止痛类药物：口服布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等非甾体抗炎药，就能起到止痛的效果。
生殖器疱疹上火的患者，治疗期间注意以清淡的食物为主，多吃水果蔬菜，多吃具有清热去火功效的食物辅助治疗。另外要戒烟戒酒，不喝咖啡、浓茶、碳酸类的饮料，可以多喝温水以便促进病情更快恢复。