手足口病是一种常见的儿童传染病，主要通过呼吸道、消化道和密切接触传播。患有手足口病的孩子晚上哭闹的原因主要有以下几点：

1. 疼痛感加剧：手足口病会导致口腔、手部和足部出现疱疹，这些疱疹在晚上可能会因为体位的改变而受到压迫，从而引发疼痛，使孩子感到不适，因此会在夜间哭闹。

2. 发热症状：手足口病常伴有发热症状，晚上体温可能会升高，导致孩子感到不适，进而哭闹。

3. 口腔不适：手足口病的疱疹多出现在口腔内，这会影响孩子的进食和饮水，甚至说话时也会感到疼痛，这种不适感在夜间可能会加剧，导致孩子哭闹。

4. 睡眠障碍：由于上述的疼痛和不适，孩子的睡眠质量会受到影响，可能会出现入睡困难、易醒等问题，这也会导致孩子在夜间哭闹。

5. 情绪焦虑：手足口病的症状可能会让孩子感到害怕和不安，尤其是在夜晚，缺乏白天的活动分散注意力，孩子可能会因为焦虑和恐惧而哭闹。

对于手足口病的治疗，通常需要使用抗病毒药物如阿昔洛韦、利巴韦林等，以及对症治疗药物如布洛芬、对乙酰氨基酚等来缓解发热和疼痛症状。同时，保持口腔卫生，避免刺激性食物，给予孩子足够的关爱和安慰，也是非常重要的。如果孩子的症状持续不减或者加重，应及时就医，以免延误治疗。