枕部蛛网膜囊肿可以通过三种方法治疗，比如一般治疗、药物治疗以及手术治疗。枕部蛛网膜囊肿部分是非常的严重的，疾病发生后治疗不及时会导致囊肿破裂、出血，甚至会有生命危险，因此一旦出现症状要及时到医院就诊。
1.一般治疗
大多数的枕部蛛网膜囊肿是良性的，发生后如果没有明显的症状，或者是囊肿比较小，可以先不用去治疗，只要定期到医院复查即可，最好3~6个月检查一次。
2.药物治疗
目前来说治疗枕部蛛网膜囊肿的药物有很多，主要是根据病情对症下药，如果出现癫痫发作时，可以服用抗癫痫的药物。若出现颅内压增高，可以静脉注射甘露醇、高渗钠等脱水的药物来，降低颅内压。但是要注意药物不能使囊肿缩小，只能缓解症状。
3.手术治疗
发生枕部蛛网膜囊肿后，如果囊肿不断生长，压迫到周围的脑组织，建议选择手术治疗，比如开颅手术切除，具体的方法是注射麻醉后开颅，通过吸引器吸收掉囊肿内的液体，使囊肿缩小，然后再切除囊肿。如果囊肿的边缘和大脑皮层、周围神经发生粘连，需要先解除粘连。