没有明确研究表明晨尿什么时候最好，一般建议留取中段尿液进行检查。建议先去医院就诊咨询，遵照医嘱留取晨尿。
晨尿，即早晨起床后第一次排尿的尿液，是进行尿液检测的样本。由于夜间人体水分摄入减少，晨尿中的溶质浓度相对较高，这有助于检测出微量的病理成分，如蛋白质、糖分等。且晨尿在膀胱内停留时间较长，其pH值相对稳定，有利于保持尿液中各种成分的稳定性，减少因环境变化导致的检测结果误差。
晨尿能够较好地反映出人体在夜间休息状态下的代谢情况，对于诊断一些慢性疾病或代谢性疾病具有重要意义。采集相对方便，不需要特殊的设备或条件，适合在家中自行操作，为日常健康监测提供了便利。一般建议留取晨尿的中段尿送检，以辅助诊断疾病。
在检查结果出来后，如果有相关疾病，应积极配合医生进行治疗。日常应注意多喝温水促进代谢、小便后由前至后擦拭干净。