通常新生儿病毒感染的原因主要有母婴传播、接触感染、医源性感染、环境因素、免疫功能低下等。
1.母婴传播：
母婴传播是新生儿病毒感染较常见原因。孕期母亲若感染病毒，病毒可通过胎盘、产道等途径传播给胎儿或新生儿。如母亲感染风疹病毒，孕期可经胎盘使胎儿感染，导致先天性风疹综合征。孕期母亲应做好病毒筛查，若感染病毒，需在医生指导下规范治疗，必要时终止妊娠。
2.接触感染：
新生儿皮肤黏膜娇嫩，与感染病毒的人员密切接触易被感染。如家庭成员中有感冒患者，未做好隔离，病毒可通过飞沫、接触等方式传给新生儿。家中有患者时应尽量避免接触新生儿，接触时需戴口罩、洗手。
3.医源性感染：
在医疗操作过程中，若医疗器械、医护人员操作不规范等，可导致新生儿感染病毒。如输液时未严格无菌操作。医院应加强医护人员培训，严格执行无菌操作规程。
4.环境因素：
新生儿所处环境若卫生条件差、通风不良，病毒易滋生繁殖，增加感染风险。如病房拥挤、消毒不彻底等。应保持新生儿居住环境清洁、通风，定期消毒。
5.免疫功能低下：
新生儿免疫系统发育不完善，免疫功能相对低下，对病毒的抵抗力弱，易发生感染。如早产儿免疫功能更差，更易感染。对于免疫功能低下的新生儿，可给予必要的免疫支持治疗。
日常应加强对新生儿的护理，保持环境清洁卫生，避免接触感染源，规范医疗操作，增强新生儿免疫力。