腺病毒合并感染的治疗方法有药物治疗、对症治疗、支持治疗、免疫调节治疗、中医治疗等。
1. 药物治疗：
腺病毒目前尚无特效抗病毒药物，但一些药物可缓解症状。如利巴韦林颗粒，能抑制病毒核酸合成，对腺病毒有一定抑制作用；阿昔洛韦片，可干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒复制；更昔洛韦胶囊，对腺病毒有一定的抗病毒活性，遵医嘱使用。
2. 对症治疗：
针对腺病毒合并感染引起的不同症状进行处理。如发热时使用对乙酰氨基酚片退热，咳嗽咳痰可用氨溴索口服液祛痰止咳，鼻塞流涕可使用伪麻黄碱滴鼻液缓解，均需按说明使用。
3. 支持治疗：
患者因腺病毒合并感染可能出现身体虚弱等情况，需补充足够的水分、电解质和营养物质。可通过静脉输注葡萄糖注射液、生理盐水等补充能量和维持水电解质平衡，还可适当补充蛋白质等营养成分。
4. 免疫调节治疗：
可使用免疫调节剂增强机体免疫力以对抗腺病毒合并感染。如胸腺肽肠溶片，能调节和增强人体细胞免疫功能；转移因子口服液，可提高机体免疫力，具体用法遵医嘱。
5. 中医治疗：
根据患者症状体征辨证论治，如使用银翘解毒丸等中成药，具有清热解毒作用，对腺病毒合并感染引起的发热、咽痛等有一定疗效；也可使用中药方剂，需由中医师根据病情调配，按医嘱服用。
患病期间要多休息，保持良好生活习惯，饮食清淡易消化，密切关注病情变化，如有加重及时就医。