治疗湿遏卫气证可选用藿香正气水、三仁汤、甘露消毒丹、藿朴夏苓汤、王氏连朴饮等药物。
1. 藿香正气水：主要由藿香、紫苏叶、白芷、白术等组成。具有解表化湿、理气和中的功效。对于外感风寒、内伤湿滞所致的湿遏卫气证，如头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻等症状有较好的疗效。它能有效驱散体表寒湿，调节脾胃功能，改善湿邪困阻的状态。
2. 三仁汤：由杏仁、白蔻仁、薏苡仁、厚朴等组成。其功效为宣畅气机、清利湿热。适用于湿温初起及暑温夹湿，湿重于热的湿遏卫气证，常见症状有头痛恶寒、身重疼痛、面色淡黄、胸闷不饥等。该方着重于宣化三焦湿邪，使湿邪从气分透解。
3. 甘露消毒丹：主要成分有滑石、茵陈、黄芩、石菖蒲等。有清热解毒、利湿化浊的作用。针对湿温时疫，邪在气分，湿热并重的湿遏卫气证，表现为发热倦怠、胸闷腹胀、肢酸咽痛、身目发黄等症状，能起到清热利湿、解毒化浊的效果。
4. 藿朴夏苓汤：由藿香、厚朴、半夏、茯苓等组成。能解表化湿。对于湿遏卫气证中偏于湿困脾胃，出现恶寒发热、身热不扬、肢体困倦、胸闷口腻等症状较为适宜，有助于化湿和中，解除湿邪对卫气的阻滞。
5. 王氏连朴饮：包含黄连、厚朴、石菖蒲、半夏等。具有清热化湿、理气和中的功效。多用于湿热蕴伏，湿遏卫气证见发热烦躁、胸脘痞闷、呕恶泄泻等症状，可清热燥湿，调理气机。
在选用药物时，应结合自身具体症状和体质，在专业医生的指导下合理用药，不可自行盲目服用，以免药不对症，影响病情恢复。