两只眼睛对焦不在一点，可能是由多种原因引起的，如眼肌功能异常、屈光不正、神经系统问题、外伤、先天性因素等。
1. 眼肌功能异常：眼外肌的力量不平衡或协调不良，可能导致双眼无法正常对焦。这可能是由于眼肌本身的问题，也可能是神经支配异常引起的。解决办法是进行眼肌训练或手术治疗，以调整眼肌的力量和协调性。
2. 屈光不正：近视、远视或散光等屈光问题，如果未得到正确矫正，可能会影响双眼的对焦。通过佩戴合适的眼镜或隐形眼镜来矫正屈光不正，有助于改善双眼对焦情况。
3. 神经系统问题：某些神经系统疾病，如脑部病变或神经麻痹，可能影响眼部肌肉的控制，导致双眼对焦异常。这种情况需要针对神经系统问题进行治疗，以恢复眼部肌肉的正常功能。
4. 外伤：眼部受到外伤，可能损伤眼外肌或影响眼部的结构，从而导致双眼对焦困难。根据外伤的具体情况，可能需要进行手术修复或其他治疗措施。
5. 先天性因素：有些人可能天生存在眼部结构异常或眼肌发育不良，导致双眼对焦问题。这种情况可能需要根据具体情况进行个体化的治疗方案，如手术或其他矫正方法。
在日常生活中，如果发现双眼对焦不在一点，应及时就医，进行详细的眼部检查和评估，以确定具体原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保护眼睛，避免过度用眼和眼部受伤。
