由于HIV为艾滋病的致病因子，机体一旦受感染后，就会引起免疫系统的破坏，因此，艾滋病在发病过程中就会引起各种病因的机会性感染及肿瘤等合并症。而且合并症又能再继发合并症，如Kaposi肉瘤可同时合并中枢神经系统感染。艾滋病患者由于免疫功能低下，尤其晚期，不但常继发其他疾病，而且可致多器官衰竭(MOSF)，继发代谢性脑病。