由于先天性解剖变异和(或)后天性因素引起局部解剖的改变，使肠系膜上动脉压迫十二指肠水平部，导致十二指肠淤滞和扩张。
1.先天解剖变异
(1)肠系膜上动脉和腹主动脉之间的角度过小：十二指肠水平部位于腹膜后，从右至左横跨第三腰椎和腹主动脉，其上前方有肠系膜上动脉血管神经鞘骑跨。肠系膜上动脉一般在第一腰椎水平处分出，与腹主动脉呈50°～60°角。正常成人在十二指肠水平部前方有时可见肠系膜上动脉的压迹，如果肠系膜上动脉和腹主动脉之间的角度过小，或肠系膜上动脉从腹主动脉的分支部位过低，可压迫从中间通过的十二指肠引起梗阻症状。
(2)十二指肠位置高：由于十二指肠悬韧带过短或增厚，致使十二指肠位置较高，引起肠系膜上动脉对十二指肠压迫症状。
(3)脊柱前突：脊柱前突导致肠系膜上动脉和腹主动脉之间的角度过小。
2.其他导致肠系膜上动脉压迫十二指肠的情况
(1)瘦长体型：瘦长体型及各种原因的消瘦可以削弱肠系膜对十二指肠水平部的支撑作用，内脏下垂牵拉肠系膜常为本病的重要病因。
(2)手术后粘连：腹腔内手术后粘连牵拉肠系膜可造成肠系膜上动脉对十二指肠水平部的明显压迫。