应与下列疾病相鉴别：
1.结核性腹膜炎 本病主要以儿童、青少年及女性多见。临床上有亚急性型及慢性等多种表现，多数有低热、体弱、消瘦、贫血、腹泻等中毒症状，腹水较常见，常有轻度的压痛和肌紧张，呈典型的“面团样”触感，结核菌素试验有诊断价值。
2.非特异性肠系膜淋巴结炎 本病好发于学龄前及学龄儿童，男孩较多;患儿常有近期上呼吸道感染史;典型的症状为脐周、右下腹及右侧腹绞痛，疼痛间歇期患儿感觉良好，白细胞计数增高。
3.棘球绦虫囊肿 本病最多见于牧区居民、男性较多，临床表现无鉴别意义，但借沉淀试验、补体结合试验、Casoni试验可鉴别。
4.肠系膜囊肿 肠系膜囊肿与网膜囊肿在临床上很难鉴别，选择性肠系膜上动脉造影有重要意义。肠系膜囊肿可使肠系膜血管被推向上或被分开。
5.腹水 巨大型囊肿需与腹水相鉴别，侧位腹部平片上可见网膜囊肿位于肠管的前方。对于诊断困难者，可作穿刺抽液，再减至或等量注入空气摄片，囊肿表现为气液平面而非膈下游离气体。
6.卵巢囊肿 巨大囊肿还需与卵巢囊肿相鉴别。