导致胆石性肠梗阻的原因是巨大的胆石进入肠道，能引起肠腔堵塞梗阻的结石直径一般在2.5cm以上，Turner报道1例胆石直径达17.7cm。
1.胆道与胃肠道之间存在异常通道
此为胆石性肠梗阻的病理基础，常见的胆道-胃肠道的异常通道有：胆总管-十二指肠内瘘、胆囊-十二指肠内瘘、胆囊-结肠瘘、胆囊-胃瘘、胆总管-十二指肠瘘等，其中胆囊-十二指肠瘘约占3/4。胡国斌等人曾收治1例肝胆管结石病人，发现其左肝管与胃之间存在一个巨大内瘘口，结石可以通过瘘口进入肠道。
2.医源性因素
内引流的目的是重建通畅的胆汁引流，其实质则相当于人工形成的胆肠内瘘，以利于结石通过。如肝胆管结石行胆肠内引流术后。湖南省人民医院曾报道1例接受肝胆管盆式内引流术后并发胆石性肠梗阻。
引起梗阻的胆石大多数为1枚至多枚。胆石性梗阻可发生于肠道的任何部位，但最易发生回肠末端。巨大胆石进入肠腔的近端，随结石不断下降，梗阻平面逐渐下降。结石可压迫肠壁，使其缺血、渗出增加，近端扩张的肠袢内可积聚过多液体。肠壁坏死、穿孔，肠内物漏出肠腔进入腹腔，形成弥漫性腹膜炎。
