1.肌萎缩侧索硬化症 多在中年以后发病，缓慢进展，多表现为四肢上下运动神经元性瘫痪，手肌萎缩比较明显，常伴有肌肉颤动。也可累及尾组运动性脑神经，出现吞咽困难，构音障碍，舌肌与胸锁乳突肌萎缩。无感觉障碍，也不伴有肝脏疾病。
2.遗传性痉挛性截瘫 多在儿童期发病，呈缓慢进展的双下肢痉挛性截瘫和剪刀式步态，并伴有轻度共济失调。随年龄增长而病情稳定或有好转。多有明显的家族史，无肝病表现。
3.亚急性脊髓联合变性 中年起病，呈亚急性或慢性进展，病程长。临床表现有贫血症状如倦怠、乏力、舌炎、腹泻及皮肤黏膜苍白等。以后出现脊髓后索与侧索的锥体束损害征。可伴有周围神经损害，呈痉挛共济失调步态，闭目难立征阳性。
4.多发性硬化症(MS)：有复发缓解史，脑液出现寡克隆带,激素治疗有效.
5. 急性脊髓炎：为病毒感染所致,病变多累及颈及上胸段脊髓或全部，MRI 增强扫描示脊髓病灶有轻度斑片强化.
6. 血管畸形和脊髓占位性病变：脊髓碘油造影、血管造影及脊髓CT、MRI，检查可明确诊断。此外还需与神经梅毒、HTLV(人T 细胞白血病淋巴瘤病毒)-Ⅰ型脊髓病鉴别。